В 1980 году в Брянском сельскохозяйственном институте был организован Агрозооинженерный факультет. В 1981 году он был разделен на агрономический и зооинженерный факультеты (приказ № 6 от 30. 12. 1981 г.). В соответствии с имеющейся лицензией и приказом министерства сельского хозяйства РФ факультет имел право на ведение общеобразовательной деятельности по специальности 310200 - Агрономия (очная и заочная формы обучения). Срок обучения по дневной форме - 4 года и 10 месяцев, на заочной - 6 лет. Установленные лицензией нормативы к данной специальности выполнялись полностью.

На основании решения Учёного совета Брянской ГСХА от 31. 10. 1997 г. и 11.12.1997 г. "О внесении изменений в названия некоторых факультетов и кафедр академии" агрономический факультет был переименован в Агроэкологический институт (АЭИ), приказ ректора № 412 от 23.12.1997 г., приказом ректора №159-К от 30.08.2016 года после реорганизации экономического факультета и агроэкологического института получил название Институт экономики и агробизнеса и является структурной единицей Брянского ГАУ. В соответствии с имеющимися лицензиями и приказом Министерства сельского хозяйства РФ Агроэкологический институт имел право на ведение общеобразовательной деятельности по специальностям 310200 "Агрономия" (очная и заочная форма обучения), специальности 320400 "Агроэкология" (очная форма обучения) и специальности 311200 "Технология производства и переработки сельскохозяйственной продукции" (очная форма обучения). Срок обучения по очной форме обучения обеих специальностей - 5 лет, по заочной - 6 лет. На специальности 310200 "Агрономия" были введены две специализации 310205 - "Агробизнес" и 310209 - "Информационно-консультативная служба в земледелии" установленные лицензиями нормативы по данным специальностям и специализациям выполняются полностью.

После прохождения в 2005 году государственной аттестации и аккредитации Агроэкологический институт, в соответствии с имеющимися лицензией А 165048, регистрационный № 5936 от 02 февраля 2006 года, выданной Федеральной службой по надзору в сфере образования, и свидетельства о государственной аккредитации, регистрационный № 0008 от 20 марта 2006 года Агроэкологический институт вел подготовку по трём специальностям:

Подготовка специалистов велась 5 лет по очной форме обучения. Установленные лицензиями нормативы по данным специальностям и специализациям выполнялись полностью.

С 2011 по 2013 учебные годы Агроэкологический институт вел набор бакалавров и магистров по следующим направлениям и профилям:

110100 «Агрохимия и агропочвоведение» (Агроэкология)

110400 «Агрономия» (Луговые ландшафты и газоны)

110900 «Технология производства и переработки сельскохозяйственной продукции» (Технология производства, хранения и переработки продукции растениеводства)

110400.68 «Агрономия» - магистр

С 2014 учебного года Институт экономики и агробизнеса ведет набор бакалавров и магистров по следующим направлениям и профилям:

35.03.03«Агрохимия и агропочвоведение» (Почвенно-агрохимическое обеспечение АПК)

35.03.04«Агрономия» (Защита и карантин растений)

35.03.07«Технология производства и переработки сельскохозяйственной продукции» (Технология производства, хранения и переработки продукции растениеводства)

Экзамены – биология, русский язык, математика.

35.04.04 «Агрономия» - магистр

С 2015 учебного года Институт экономики и агробизнеса ведет набор магистров по следующему направлению:

35.04.03 Агрохимия и агропочвоведение - магистр, заочная форма

Сроки обучения. Полный срок обучения у бакалавров - 4 года очно, 5 лет заочно, у магистров - 2 года очно, 2 года 4 месяца очно-заочно. Абитуриенты, имеющие среднее профессиональное образование по профилю, могут обучаться по ускоренным программам очной и заочной форм обучения. Зачисление производится по результатам вступительных испытаний профильной направленности, проводимых университетом самостоятельно в форме бланкового тестирования по биологии, математики и русскому языку.

В рамках федеральных государственных образовательных стандартов третьего поколения (3++) обучение ведется по двум экономическим направлениям подготовки и четырем профилям:

- направление подготовки «Экономика», профиль - экономика предприятий и организаций;
- направление подготовки «Менеджмент», профиль - производственный менеджмент.

  Зачисление абитуриентов производится по результатам ЕГЭ. Нормативный срок очного обучения бакалавра 4 года., 5 лет заочного.  Студенты института изучают дисциплины гуманитарного и социального цикла: философию, иностранный язык, историю, право, социологию, политологию. Особое место в подготовке бакалавров отводится изучению высшей математики, экономики предприятия, бухгалтерского учета, аудита, менеджмента, маркетинга, коммерческой деятельности, финансов, статистики, вычислительных систем, баз данных, информационных технологий и других специальных дисциплин. В распоряжении студентов имеется библиотеки, читальный зал, общежития, спортивные залы и стадион. За время учебы студенты получают и ряд рабочих профессий, таких как пользователь персонального компьютера, водитель автотранспорта, выдается удостоверение пользователя "1С". На базе института проходит региональный этап всероссийской олимпиады школьников по экономике.

Институт является членом учебно-методических объединений:
- Российского государственного аграрного университета – МСХА имени К.А. Тимирязева;
- Государственного университета управления;
- Финансового университета при Правительстве РФ;
- Российского экономического университета имени Г.В. Плеханова;
- Московского государственного университета экономики, статистики и информатики.

Большая заслуга в создании и становлении института, а в дальнейшем института, и значительный вклад в подготовку специалистов, издание учебной и методической литературы, развитие научных исследований по актуальным проблемам АПК принадлежит Путинцеву Н.И., Куклину А.К., Высоцкому А.А., Иванову В.П., Островерховой А.В., Сергееву В.Г., Лысенко Н.Ф., Нестеренко А.Г., Михалёву И.К., Галактионову В.Ф., Косьянчуку В.П., Рулинской Н.С., Мальцеву В.Ф., Казакову И.В., Просянникову Е.В., Айтжановой С.Д., Попову А.А., Васильеву М.Е., Осмоловскому В.В., Серяеву В.В., Наумовой М.П.

Ежегодно в институте обучаются 700 студентов (на 1 ноября 2024 г.), в том числе граждане из ближнего и дальнего зарубежья.

Учебный процесс ведут 17 докторов наук, профессоров, 23 кандидата наук, доцентов и старших преподавателей. Доля преподавателей с учеными степенями и званиями в институте составляет 81%.

Остепенённость кафедр института

Обеспечение студентов учебной, учебно-методической литературой и методическими пособиями осуществляется за счет собственного библиотечного фонда. Учебная литература современная (3-5 лет). Ежегодно приобретается литература выпускаемая центральными издательствами и хранится в библиотечном фонде. По дисциплинам всех циклов рабочего учебного плана институт располагает основными (базовыми) учебниками и учебными пособиями, в том числе по практическим занятиям в количестве 2-3 экземпляра на одного обучающегося по циклу общеобразовательных и специальных дисциплин.
Образовательный процесс организован в 6 учебных корпусах, расположенных в непосредственной близости, что позволяет организовать образовательный процесс по всем направлениям и дисциплинам строго в специализированных лабораториях и кабинетах. Учебно-воспитательную работу совместно с дирекцией института осуществляют четыре кафедры и три учебно-научные лаборатории. 

Все кафедры института обеспечивают ведение учебного процесса во всех учебных подразделениях.
В институте для всех кафедр и подразделений разработаны положения и должностные инструкции работников, юридически упорядочивающие всю деятельность института: образовательную, научно-методическую, научно-исследовательскую. Все нормативные документы соответствуют действующему законодательству.
Все кафедры имеют свою четко выраженную направленность в научных исследованиях. 
При институте имеется опытное поле, заложено в 1983 году общей площадью 150 га, на котором сотрудниками и студентами проводятся учебные практики, научные исследования по результатам которых, выполняются выпускные квалификационные работы, кандидатские и докторские диссертации. Опытное поле является достоянием Российской сельскохозяйственной науки и включённое в реестр Географической сети опытов с удобрениями и другими агрохимическими средствами, а в 2005 году Российской академией сельскохозяйственных наук ему присвоен Аттестат длительного опыта за № 030.
Институт имеет общежитие на 300 мест, что позволяет обеспечить жильем всех нуждающихся студентов и аспирантов. На одного студента приходится 6 м² общей площади (при норме 6 м²)

Кафедра агрохимии, почвоведения и экологии проводит научные исследования по двум комплексным направлениям: «Совершенствование систем земледелия, технологий производства и сортового состава сельскохозяйственных культур в юго-западной части России» и «Мониторинг почвенного покрова в агpоландшафтах юго-запада России, загрязненных выбросами Чеpнобыльской АЭС, и разработка предложений по оперативной корректировке систем ведения сельскохозяйственного производства», под руководством доктора с/х наук, профессора, заслуженного деятеля науки РФ, академика РАЕН Просянникова Е.В., докторов с/х наук, профессоров Малявко Г.П., Смольского Е.В., кандидатов с.-х. наук: Мамеева В.В. и др. В выполнении данной тематики задействованы сотрудники, аспиранты этой и других кафедр и студенты. Кафедра проводит научные исследования совместно с рядом ведущих научных организаций. Заключены договора о творческом сотрудничестве с ВНИИ физиологии, биохимии и питания с/х животных (Боровск, Калужской области), ВНИИ экспериментальной ветеринарии (Москва), ВНИТИ биологической промышленности (Щелково, Московской обл.). Сотрудники кафедры проводят исследования по теме: «Пути повышения продуктивности и качества продукции животноводства в условиях юго-западной части Нечерноземья России, загрязненной радионуклидами», под руководством доктора с.- х. наук, профессора Талызиной Т.Л., а также по теме «Эколого-геохимическая оценка торфяных почв Брянской области», под руководством кандидата с.-х. наук Чекина Г.В.
На данной кафедре при финансовой поддержке комитета по делам молодежи администрации Брянской области в 2003-2005 годах, проводились студенческие научно-экологические экспедиции "Сталкер" по тематике "Выявление и популяризация особенностей безопасной жизнедеятельности в условиях антропогенного загрязнения".

Кафедра агрономии, селекции, семеноводства проводит исследования по комплексной теме "Научные основы ресурсосберегающих технологий возделывания полевых с. - х. культур при разных уровнях применения средств химизации" под руководством докторов с.-х. наук, профессоров: Торикова В.Е., Мельниковой О.В.. В выполнении данной темы принимают участие сотрудники данной кафедры: кандидаты с.-х. наук: Никифоров М.И.,  и другие, а также аспиранты и студенты института.Также проводит научные исследования по комплексному проекту "Оптимизация системы полевого кормопроизводства юго-западной части Центрального региона России", под руководством докторов с/х наук, профессоров: Дронова А.В., Дьяченко В.В., Шпилёва Н.С., результативно ведет исследования в области селекции ягодных культур (малины и земляники). Ее научные исследования широко известны в странах ближнего и дальнего зарубежья. Вторая основная комплексная тема НИР этой кафедры "Совершенствование технологии и сортимента плодоовощных культур в юго-западной части Нечерноземья России" выполнялась под руководством доктора с/х наук, заслуженного деятеля науки РФ, член кор. РАСХН, обладателя Золотой медали им. И. В. Мичурина профессором Казаковым И.В., а в настоящее время профессорами: Евдокименко С.Н., Сычёвым С.М., Сазоновым Ф.Ф. Индивидуальная НИР сотрудников кафедры кандидатов с.-х. наук: Сычёвой И.В., Симонова В.Ю., Анроновой Н.В.  и др. вписывается в направления этого проекта. В выполнении исследований по данной теме принимают участие также аспиранты и студенты.

В институте применяются следующие формы проведения занятий: лекции, лабораторно-практические занятия, практические семинары, деловые игры, коллоквиумы, работа за компьютерами. С целью активизации учебного процесса на кафедрах, в институте проводится публичная защита рефератов, курсовых работ, отчетов по учебной и производственной практикам, проведение ежегодных Международных научных конференций молодых ученых и студентов.

Ученым советом института утверждается положение и программа производственной практики, где определены основные этапы ее организации и проведения, руководство, формы отчетности и аттестации. Организационное руководство учебной и производственной практикой осуществляют директор института и его заместители, а методическое - заведующие профилирующими кафедрами. Руководство производственной практикой осуществляют руководители, которые выдают студентам индивидуальные задания и разрабатывают совместно методику для проведения исследований с последующим выполнением выпускной квалификационной работы. После завершения практики студенты представляют на кафедру отчеты и публично их защищают. На опытном поле института и на заложенных в различных районах Брянской области мониторинговых ключах, начиная с 1-го курса студенты проходят учебные и научно-исследовательские практики. Кроме этого часть учебных практик проводится на производственной базе учебно-опытного хозяйства "Кокино" БГАУ, а так же в филиалах кафедр: агрохимии, почвоведения и экологии на базе центра "Брянскагрохимрадиология"; экологического растениеводства на базе ООО БМК; плодоовощеводства на базе тепличного хозяйства агрофирмы "Культура", ТНВ «Десна». Производственную практику студенты проходят в передовых хозяйствах Брянской области и прилегающих хозяйствах других областей; научно-исследовательских учреждениях России (ВНИИССОК, ВНИИ люпина, ВНИИ кормов и др.).